288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4715 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4715  thiosulphate-binding protein  100 
 
 
378 aa  759    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3492  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  70.45 
 
 
377 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  63.29 
 
 
381 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3629  sulfate ABC transporter periplasmic sulfate-binding protein  64.65 
 
 
363 aa  428  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3352  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.53 
 
 
348 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.59657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1722  thiosulphate-binding protein  60.84 
 
 
361 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2750  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.7 
 
 
338 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3454  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.06 
 
 
346 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2764  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.56 
 
 
361 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8377  normal  0.37323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1681  thiosulphate-binding protein  62.01 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235432  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0044  thiosulphate-binding protein  62.14 
 
 
385 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.49 
 
 
337 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.02 
 
 
341 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.85 
 
 
339 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.39 
 
 
345 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.85 
 
 
339 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  48.21 
 
 
337 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1686  thiosulphate-binding protein  44.16 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.13 
 
 
342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  48 
 
 
336 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.39 
 
 
337 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.33 
 
 
337 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  46.03 
 
 
327 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.67 
 
 
337 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  48.5 
 
 
332 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  45.1 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.3 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  47.7 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.48 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  46.73 
 
 
329 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.04 
 
 
336 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  47 
 
 
332 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  45.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.88 
 
 
329 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.67 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.32 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  44.95 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.71 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  45.28 
 
 
329 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  44.95 
 
 
329 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  45.54 
 
 
330 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  46.08 
 
 
344 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  44.95 
 
 
329 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  44.95 
 
 
329 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  46.36 
 
 
346 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  44.3 
 
 
329 aa  266  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.76 
 
 
329 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  44.41 
 
 
342 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  43.19 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  45.28 
 
 
807 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3186  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  40.63 
 
 
352 aa  262  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0691326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.93 
 
 
341 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.91 
 
 
351 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1450  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.54 
 
 
343 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.601582  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.36 
 
 
335 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.98 
 
 
337 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0259  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.31 
 
 
345 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.904874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  44.7 
 
 
335 aa  260  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  44.95 
 
 
798 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1638  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.66 
 
 
345 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.749782  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  44.13 
 
 
329 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  43.63 
 
 
351 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  45.67 
 
 
332 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1223  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.91 
 
 
358 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.1 
 
 
335 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  45.57 
 
 
329 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.04 
 
 
331 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  43.53 
 
 
365 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.69 
 
 
341 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.1 
 
 
336 aa  255  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.03 
 
 
343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  44.09 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  47.06 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  45.24 
 
 
335 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.03 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  44.65 
 
 
354 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0698  ABC transporter sulfate binding protein  42.22 
 
 
339 aa  252  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  44.95 
 
 
337 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.39 
 
 
340 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0170  sulfate transporter subunit  42.07 
 
 
329 aa  251  1e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1799  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.52 
 
 
356 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.689523  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0618  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.14 
 
 
339 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0236749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1826  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.73 
 
 
340 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1923  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.52 
 
 
339 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  42.76 
 
 
337 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.46 
 
 
335 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.46 
 
 
335 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.85 
 
 
345 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1572  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.25 
 
 
344 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0814  sulfate-binding protein  42.67 
 
 
328 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2803  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.73 
 
 
336 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.63 
 
 
341 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>