288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1826 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1826  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
340 aa  696    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.81 
 
 
356 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.15 
 
 
359 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  55.73 
 
 
346 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  58.65 
 
 
330 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.96 
 
 
337 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.76 
 
 
331 aa  355  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  55.29 
 
 
329 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  57.14 
 
 
329 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  56.35 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  54.12 
 
 
336 aa  352  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.83 
 
 
343 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.24 
 
 
340 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  54.98 
 
 
331 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.1 
 
 
337 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.79 
 
 
336 aa  349  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.12 
 
 
332 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  58.31 
 
 
332 aa  348  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.63 
 
 
341 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  54.17 
 
 
351 aa  348  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.47 
 
 
336 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  53.73 
 
 
329 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  54.38 
 
 
329 aa  346  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  54.29 
 
 
329 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.29 
 
 
329 aa  345  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  54.29 
 
 
329 aa  345  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  54.29 
 
 
329 aa  345  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  54.29 
 
 
329 aa  345  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  54.29 
 
 
329 aa  345  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0698  ABC transporter sulfate binding protein  53.27 
 
 
339 aa  346  4e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  54.29 
 
 
329 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  54.29 
 
 
329 aa  345  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0618  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.27 
 
 
339 aa  345  6e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0236749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.14 
 
 
329 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  56.49 
 
 
329 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  54.17 
 
 
351 aa  345  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.44 
 
 
351 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.13 
 
 
341 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  51.45 
 
 
354 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.06 
 
 
342 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  53.99 
 
 
329 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  57 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  53.59 
 
 
327 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1629  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.98 
 
 
347 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482062  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  55.66 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.22 
 
 
341 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  55.66 
 
 
329 aa  341  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  55.66 
 
 
329 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  55.66 
 
 
329 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1773  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.1 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1799  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.34 
 
 
356 aa  339  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.689523  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.82 
 
 
336 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  53.29 
 
 
342 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.64 
 
 
339 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  55.34 
 
 
329 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1923  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.34 
 
 
339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.22 
 
 
337 aa  338  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  52.02 
 
 
335 aa  338  9e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.34 
 
 
339 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  52.38 
 
 
365 aa  338  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.6 
 
 
335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  55.19 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  52.71 
 
 
335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.87 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  55.34 
 
 
342 aa  335  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.69 
 
 
337 aa  335  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  56.54 
 
 
335 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  55.84 
 
 
329 aa  334  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0170  sulfate transporter subunit  52.44 
 
 
329 aa  334  1e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  54.4 
 
 
336 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.92 
 
 
345 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.85 
 
 
337 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3046  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.13 
 
 
341 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5393  ABC transporter substrate binding protein (sulfate)  52.91 
 
 
338 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0845321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  54.22 
 
 
338 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  54.98 
 
 
332 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  55.34 
 
 
336 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  55.99 
 
 
331 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0120  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.37 
 
 
342 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  54.69 
 
 
337 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4544  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.49 
 
 
341 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.55 
 
 
345 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2981  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.21 
 
 
345 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.22 
 
 
345 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.59 
 
 
329 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  54.05 
 
 
344 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  54.22 
 
 
345 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.22 
 
 
345 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  54.69 
 
 
329 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  55.81 
 
 
337 aa  328  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.02 
 
 
335 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0089  sulfate transporter subunit  54.69 
 
 
329 aa  328  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4125  sulfate transporter subunit  54.69 
 
 
329 aa  328  9e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.37 
 
 
341 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.69 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.02 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.9 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.9 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.5 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1223  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.07 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>