30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00556 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  49.61 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  43.72 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  43.91 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  43.91 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  41.92 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  41.81 
 
 		 256 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  40.52 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  39.22 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  37.83 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  37.19 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  33.33 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  31.9 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  31.9 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  31.13 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  28.88 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1884  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.61 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1619  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.53 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0273335  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1528  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.76 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00368148 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.12 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.448205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0208  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.75 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.726895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3266  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.02 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0384  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.8 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2847  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.35 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  29.56 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3447  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.75 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0259  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.07 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0723  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0538  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  27.67 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1666  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.33 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>