83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1760 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  52.24 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  50.41 
 
 
256 aa  267  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  53.85 
 
 
250 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  53.85 
 
 
250 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  43.72 
 
 
265 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  39.11 
 
 
254 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  41.35 
 
 
255 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
258 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  36.96 
 
 
253 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  37.8 
 
 
259 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  33.6 
 
 
247 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  32.76 
 
 
247 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  33.47 
 
 
246 aa  121  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  33.06 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  31.62 
 
 
243 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.69 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233518  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0259  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.53 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1585  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.85 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.296141  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1619  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.1 
 
 
257 aa  52  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0273335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0538  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  24.18 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1884  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.05 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  27.22 
 
 
331 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  33.97 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0208  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.3 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.726895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.27 
 
 
336 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.29 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  30.25 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  34.46 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  32.35 
 
 
329 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0991  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.38 
 
 
637 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0710453 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.16 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3174  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  33.66 
 
 
377 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.52 
 
 
359 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  25.16 
 
 
334 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  28.66 
 
 
336 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3447  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  19.83 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1020  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.41 
 
 
280 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.73823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1978  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.9 
 
 
323 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.9 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0814  sulfate-binding protein  32.03 
 
 
328 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  44.68 
 
 
329 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.48 
 
 
807 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1132  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  25.79 
 
 
372 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1543  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.33 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2338  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.91 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895899  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0241  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.13 
 
 
331 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.276521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1547  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  30 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1528  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.12 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00368148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1223  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  30.67 
 
 
358 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.14 
 
 
341 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  34.62 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  29.8 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.63 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  28.1 
 
 
334 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.63 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2246  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.1 
 
 
349 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1519  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  30.85 
 
 
335 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.059232  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  34.26 
 
 
328 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.18 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.41 
 
 
798 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2376  thiosulphate-binding protein  28.76 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  30.46 
 
 
332 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  32.79 
 
 
351 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.14 
 
 
343 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.07 
 
 
337 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1773  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.22 
 
 
346 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  28.75 
 
 
344 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.36 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.448205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0924  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.82 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1190  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.66 
 
 
638 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  30.89 
 
 
335 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.14 
 
 
340 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.83 
 
 
345 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.18 
 
 
345 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  41.18 
 
 
345 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  41.18 
 
 
345 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0577  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  22.18 
 
 
284 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.31 
 
 
337 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4914  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  29.87 
 
 
346 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.79 
 
 
351 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  28.95 
 
 
336 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>