43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2390 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  55.42 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  57.2 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  55.06 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  40.08 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  40.35 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  39.91 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  38 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  35.69 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  41.15 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  35.97 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  35.97 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  37.8 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  37.19 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  36.33 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.68 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.448205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1528  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.67 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00368148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1884  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.29 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0384  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.67 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1619  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.16 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0273335  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.41 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1558  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  25.13 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.455674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1978  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.71 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2560  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  24.62 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403904  normal  0.205693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3052  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  29.29 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0649  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.78 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0057193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1585  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.04 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0584  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  51.35 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0259  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.75 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0208  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.3 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.726895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2901  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.94 
 
 		 400 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3492  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  25 
 
 		 377 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0577  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  26.34 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2226  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.42 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  25.15 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1307  molybdate-binding protein  31.29 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0723  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1425  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.97 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  25.43 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0890  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.16 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.356678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1798  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.69 
 
 		 268 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2204  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.58 
 
 		 251 aa  42  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.50393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>