41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0872 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 156 aa  313  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  41.44 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  39.62 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.09 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32.96 
 
 		 180 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  39.13 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  39.42 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.84 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.09 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.36 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.08 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.36 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  36.54 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.13 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.85 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.36 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.82 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.89 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.85 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.85 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.09 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.61 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.19 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.19 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.09 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.54 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.09 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  35.58 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.58 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.09 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1363  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.66 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3361  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.43 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1309  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32.12 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.273343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  42.37 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0652  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0903  hypothetical protein  24.7 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1980  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.35 
 
 		 152 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  38.98 
 
 		 164 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  38.98 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.09 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.93 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>