37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0527 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 
181 aa  378  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  94.48 
 
 
181 aa  363  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.82 
 
 
181 aa  361  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  94.48 
 
 
181 aa  362  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.92 
 
 
181 aa  359  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.37 
 
 
181 aa  358  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.27 
 
 
183 aa  352  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.27 
 
 
181 aa  352  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  88.95 
 
 
181 aa  346  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  88.4 
 
 
181 aa  346  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  90.06 
 
 
181 aa  346  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.75 
 
 
181 aa  256  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 
180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.36 
 
 
180 aa  250  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 
180 aa  245  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.78 
 
 
185 aa  234  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  63.13 
 
 
181 aa  233  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  60.67 
 
 
189 aa  231  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  62.15 
 
 
180 aa  231  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  59.34 
 
 
181 aa  222  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  57.54 
 
 
180 aa  215  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.87 
 
 
181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  52.49 
 
 
183 aa  201  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  49.16 
 
 
166 aa  163  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  47.46 
 
 
165 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.09 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.35 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.97 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25.42 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.5 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.7 
 
 
158 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  24.58 
 
 
164 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  23.73 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.56 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.48 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1980  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.91 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>