37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0813 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 
181 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  94.48 
 
 
181 aa  366  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  94.48 
 
 
181 aa  363  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  95.03 
 
 
181 aa  364  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  94.48 
 
 
181 aa  363  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.92 
 
 
181 aa  361  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.27 
 
 
183 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.82 
 
 
181 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  90.06 
 
 
181 aa  347  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  87.85 
 
 
181 aa  347  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  87.85 
 
 
181 aa  344  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.3 
 
 
181 aa  256  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.23 
 
 
180 aa  249  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 
180 aa  249  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.92 
 
 
180 aa  242  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.34 
 
 
185 aa  235  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  60.11 
 
 
189 aa  231  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  62.15 
 
 
180 aa  231  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.89 
 
 
181 aa  230  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  58.79 
 
 
181 aa  220  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.1 
 
 
180 aa  218  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.87 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  51.93 
 
 
183 aa  201  6e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  48.6 
 
 
166 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  45.76 
 
 
165 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.36 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.43 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.7 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.21 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.7 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.85 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32.17 
 
 
158 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25.93 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  47.83 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.48 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0858  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.33 
 
 
169 aa  40.8  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979004  normal  0.0996152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>