37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1878 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 180 aa  374  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  81.56 
 
 		 180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  74.3 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  72.07 
 
 		 181 aa  274  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.36 
 
 		 181 aa  254  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.29 
 
 		 181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.36 
 
 		 181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.8 
 
 		 181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.36 
 
 		 181 aa  250  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.23 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.8 
 
 		 183 aa  248  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.8 
 
 		 181 aa  247  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.8 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.23 
 
 		 181 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.1 
 
 		 181 aa  245  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  62.92 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.54 
 
 		 181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.43 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  58.19 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.89 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  55.06 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  51.69 
 
 		 183 aa  206  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.31 
 
 		 180 aa  203  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  52.78 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  43.82 
 
 		 165 aa  154  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.84 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.26 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.26 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.95 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.95 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.61 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.29 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0858  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.65 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979004  normal  0.0996152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.74 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1363  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.26 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3361  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>