37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1537 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  100 
 
 		 189 aa  395  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.55 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.67 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.67 
 
 		 181 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.99 
 
 		 181 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.67 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.11 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.11 
 
 		 181 aa  231  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.55 
 
 		 181 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.34 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.55 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.43 
 
 		 183 aa  224  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.55 
 
 		 181 aa  224  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.19 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.66 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.74 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.42 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.31 
 
 		 181 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  53.89 
 
 		 181 aa  208  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  54.95 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  53.3 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  53.07 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  49.44 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  47.49 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  41.44 
 
 		 165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.9 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.91 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.21 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.06 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.58 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.61 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.36 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32.74 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0858  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.94 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979004  normal  0.0996152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.3 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>