39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2150 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  73.89 
 
 		 180 aa  284  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  72.78 
 
 		 181 aa  280  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  74.3 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 		 181 aa  262  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.92 
 
 		 180 aa  260  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.72 
 
 		 181 aa  251  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.16 
 
 		 181 aa  248  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.16 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 		 181 aa  245  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 		 181 aa  243  8e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 		 181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.92 
 
 		 181 aa  242  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.36 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.66 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  64.8 
 
 		 183 aa  233  8e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  63.69 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  63.69 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  58.66 
 
 		 189 aa  221  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.22 
 
 		 181 aa  221  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  54.19 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  55.31 
 
 		 181 aa  210  7.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.67 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  51.38 
 
 		 166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  46.63 
 
 		 165 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.09 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.36 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.19 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.57 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.71 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.85 
 
 		 164 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25.93 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25.93 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.34 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3361  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  37.63 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25.79 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1363  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  40.3 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0858  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  37.21 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979004  normal  0.0996152 
 
 
-
 
NC_002950  PG0903  hypothetical protein  27.97 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>