39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2492 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  73.74 
 
 		 180 aa  285  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.72 
 
 		 181 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 		 180 aa  262  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.36 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.29 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  57.54 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.42 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.1 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  57.54 
 
 		 181 aa  216  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.1 
 
 		 181 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.87 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.42 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.87 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  51.4 
 
 		 183 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  55.31 
 
 		 189 aa  211  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.31 
 
 		 181 aa  210  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.98 
 
 		 181 aa  210  9e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.42 
 
 		 183 aa  209  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.87 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  54.75 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  53.63 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  52.51 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  48.89 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  43.82 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.35 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.62 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.97 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.36 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.54 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.85 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.81 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  37.62 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.85 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.88 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0858  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.93 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979004  normal  0.0996152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1980  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794867  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0652  hypothetical protein  26.7 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.42 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>