35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1176 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 180 aa  376  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  81.56 
 
 		 180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  73.89 
 
 		 180 aa  284  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  69.44 
 
 		 181 aa  270  8.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 		 181 aa  255  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.36 
 
 		 181 aa  254  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.6 
 
 		 181 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.92 
 
 		 181 aa  250  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 		 181 aa  250  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 		 181 aa  250  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.92 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.04 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  62.01 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 		 181 aa  245  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.36 
 
 		 181 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.36 
 
 		 183 aa  243  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.22 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  60.34 
 
 		 189 aa  228  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.34 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  53.07 
 
 		 183 aa  214  7e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  53.07 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  53.89 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  46.96 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  44.94 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.07 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.08 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.45 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.63 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.63 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.7 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.81 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.78 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.66 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  29.63 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>