37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0860 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 181 aa  376  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.92 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  95.03 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  94.48 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.37 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.37 
 
 		 183 aa  357  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.37 
 
 		 181 aa  356  9e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  91.71 
 
 		 181 aa  353  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  91.16 
 
 		 181 aa  350  5e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  87.85 
 
 		 181 aa  341  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  87.29 
 
 		 181 aa  340  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  68.36 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.75 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 		 180 aa  250  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.48 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  60.11 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  62.15 
 
 		 180 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.66 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.89 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  59.34 
 
 		 181 aa  223  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  57.54 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.42 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  50.28 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  47.49 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  46.33 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  36.36 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32.79 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.21 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.85 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.78 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.85 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.7 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.36 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1980  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  31.91 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>