More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2916 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
318 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  78.62 
 
 
318 aa  481  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.67 
 
 
317 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.36 
 
 
318 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.47 
 
 
318 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.47 
 
 
318 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.47 
 
 
318 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.73 
 
 
318 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.03 
 
 
319 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.83 
 
 
319 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.29 
 
 
322 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.38 
 
 
313 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.44 
 
 
320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.68 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.66 
 
 
320 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  55 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.37 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.66 
 
 
317 aa  317  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.55 
 
 
317 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.49 
 
 
316 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.81 
 
 
316 aa  315  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.19 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.56 
 
 
319 aa  311  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.8 
 
 
320 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.63 
 
 
321 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.89 
 
 
317 aa  292  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.56 
 
 
321 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.91 
 
 
317 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.44 
 
 
316 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.48 
 
 
317 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.34 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.03 
 
 
325 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.66 
 
 
309 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.08 
 
 
317 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.78 
 
 
308 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.62 
 
 
319 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.69 
 
 
309 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.1 
 
 
329 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.86 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.66 
 
 
313 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.05 
 
 
309 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.35 
 
 
316 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.81 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.68 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.41 
 
 
309 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.41 
 
 
349 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.37 
 
 
329 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.1 
 
 
317 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.66 
 
 
322 aa  215  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  48.25 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.29 
 
 
307 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.32 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7938  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.98 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256052  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.62 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.62 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.71 
 
 
316 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.25 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.09 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.63 
 
 
307 aa  212  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.16 
 
 
307 aa  212  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.78 
 
 
309 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.05 
 
 
309 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02790  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.37 
 
 
345 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.26 
 
 
307 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.53 
 
 
308 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.77 
 
 
310 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.77 
 
 
309 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.1 
 
 
317 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.38 
 
 
308 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.28 
 
 
325 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.17 
 
 
317 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.35 
 
 
310 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.77 
 
 
313 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.26 
 
 
307 aa  208  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.38 
 
 
308 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
309 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.07 
 
 
310 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.88 
 
 
308 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.91 
 
 
312 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.38 
 
 
308 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.87 
 
 
309 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40 
 
 
328 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.5 
 
 
308 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.5 
 
 
308 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.24 
 
 
308 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05770  ETF1-related  40.19 
 
 
346 aa  206  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.61 
 
 
307 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.21 
 
 
320 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.5 
 
 
308 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  42.17 
 
 
311 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.2 
 
 
308 aa  205  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.84 
 
 
452 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.26 
 
 
310 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.17 
 
 
320 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.11 
 
 
309 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.75 
 
 
311 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.92 
 
 
329 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.94 
 
 
309 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.95 
 
 
311 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.3 
 
 
442 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>