More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1816 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
317 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  92.52 
 
 
321 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.29 
 
 
317 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.64 
 
 
317 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.58 
 
 
317 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.76 
 
 
319 aa  360  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.08 
 
 
313 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.62 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.82 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.89 
 
 
316 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.86 
 
 
320 aa  350  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.32 
 
 
316 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.68 
 
 
315 aa  348  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.99 
 
 
319 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.37 
 
 
319 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  57.81 
 
 
318 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.5 
 
 
319 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.6 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.55 
 
 
318 aa  324  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.37 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.37 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.37 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.66 
 
 
317 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.23 
 
 
318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.92 
 
 
317 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.66 
 
 
322 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.86 
 
 
318 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.19 
 
 
316 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  50.8 
 
 
321 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.55 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.24 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.4 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.38 
 
 
329 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.69 
 
 
329 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.36 
 
 
325 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.2 
 
 
328 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.36 
 
 
325 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3680  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.26 
 
 
330 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.75 
 
 
325 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.07 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.39 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.37 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.62 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.09 
 
 
447 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.31 
 
 
320 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.37 
 
 
325 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.51 
 
 
325 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.51 
 
 
325 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.51 
 
 
325 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.51 
 
 
325 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  39.51 
 
 
325 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.81 
 
 
325 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.51 
 
 
325 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.51 
 
 
325 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.34 
 
 
443 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.51 
 
 
325 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.48 
 
 
309 aa  208  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.58 
 
 
442 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.58 
 
 
441 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.37 
 
 
325 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.61 
 
 
441 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37 
 
 
340 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.42 
 
 
329 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1724  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.72 
 
 
330 aa  205  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150194  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.02 
 
 
436 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.12 
 
 
319 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.07 
 
 
334 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  42.24 
 
 
320 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  39.87 
 
 
311 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.1 
 
 
316 aa  203  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.11 
 
 
436 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.31 
 
 
313 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.73 
 
 
322 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.8 
 
 
330 aa  202  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.31 
 
 
317 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  42.9 
 
 
309 aa  201  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  41.1 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.3 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.59 
 
 
448 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.01 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.56 
 
 
316 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.63 
 
 
310 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.63 
 
 
310 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  39.18 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.67 
 
 
328 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02790  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.74 
 
 
345 aa  199  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.04 
 
 
309 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  37.31 
 
 
341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.64 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.7 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.78 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.81 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.76 
 
 
443 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.94 
 
 
311 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.81 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.45 
 
 
452 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.45 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.55 
 
 
309 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.99 
 
 
316 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.74 
 
 
309 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>