More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1211 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
319 aa  624  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  96.55 
 
 
319 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  68.97 
 
 
315 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.47 
 
 
320 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  64.26 
 
 
317 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.2 
 
 
317 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.44 
 
 
320 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.44 
 
 
313 aa  362  6e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.76 
 
 
320 aa  362  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.56 
 
 
317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.7 
 
 
316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.68 
 
 
317 aa  351  8.999999999999999e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  59.69 
 
 
318 aa  348  5e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.2 
 
 
316 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.24 
 
 
319 aa  346  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.19 
 
 
314 aa  345  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.88 
 
 
318 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.88 
 
 
318 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.88 
 
 
318 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.19 
 
 
318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.66 
 
 
321 aa  338  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.44 
 
 
319 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.06 
 
 
318 aa  328  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.92 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
318 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.25 
 
 
317 aa  305  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.09 
 
 
321 aa  292  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.65 
 
 
317 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.5 
 
 
316 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.82 
 
 
326 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.51 
 
 
325 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.06 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.31 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.56 
 
 
328 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.32 
 
 
313 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.49 
 
 
325 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.69 
 
 
329 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.44 
 
 
329 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.79 
 
 
325 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.45 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02790  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.37 
 
 
345 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.58 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.58 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.58 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.58 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.88 
 
 
340 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.74 
 
 
327 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.27 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  38.27 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.27 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.65 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.27 
 
 
325 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.27 
 
 
325 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.34 
 
 
443 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.11 
 
 
322 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.48 
 
 
317 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.68 
 
 
326 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.54 
 
 
311 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.02 
 
 
441 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.96 
 
 
309 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.08 
 
 
311 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.22 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  42.22 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.22 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.17 
 
 
320 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.22 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.22 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.22 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.72 
 
 
311 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.54 
 
 
311 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.59 
 
 
311 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.67 
 
 
334 aa  206  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.02 
 
 
309 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.65 
 
 
442 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.76 
 
 
399 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.5 
 
 
448 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  39.42 
 
 
341 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.37 
 
 
316 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.63 
 
 
308 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  46.15 
 
 
312 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.52 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.27 
 
 
311 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.27 
 
 
311 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.81 
 
 
330 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6582  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.11 
 
 
323 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.68 
 
 
308 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.27 
 
 
311 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  45.12 
 
 
321 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.99 
 
 
410 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.86 
 
 
317 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.14 
 
 
315 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.27 
 
 
311 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.27 
 
 
311 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.75 
 
 
309 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  47.19 
 
 
312 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.72 
 
 
317 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.95 
 
 
325 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.92 
 
 
308 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.29 
 
 
315 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  46.92 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>