More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1700 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  94.64 
 
 
317 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  94.64 
 
 
317 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  87.3 
 
 
317 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.41 
 
 
316 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  81.27 
 
 
316 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7938  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.19 
 
 
315 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.33 
 
 
314 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  67.41 
 
 
314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.21 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.26 
 
 
310 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.21 
 
 
309 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.99 
 
 
317 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.21 
 
 
309 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.31 
 
 
319 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.21 
 
 
309 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.86 
 
 
309 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.57 
 
 
316 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  69.52 
 
 
316 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.5 
 
 
314 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.23 
 
 
309 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.21 
 
 
309 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.58 
 
 
313 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  69.65 
 
 
314 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.21 
 
 
349 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.23 
 
 
309 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3272  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.29 
 
 
311 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.37 
 
 
308 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  63.9 
 
 
311 aa  362  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1038  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.42 
 
 
309 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.434498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.06 
 
 
313 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 
309 aa  359  4e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.77 
 
 
313 aa  358  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.64 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.41 
 
 
312 aa  355  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  60.77 
 
 
309 aa  354  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.1 
 
 
312 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.34 
 
 
313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.88 
 
 
309 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.17 
 
 
309 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
309 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.61 
 
 
308 aa  349  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  57.56 
 
 
310 aa  347  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.34 
 
 
310 aa  347  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.34 
 
 
310 aa  347  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.56 
 
 
309 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.84 
 
 
309 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  60.84 
 
 
309 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.91 
 
 
309 aa  345  7e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 
310 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  60.13 
 
 
309 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.9 
 
 
308 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.21 
 
 
310 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.24 
 
 
310 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  62.14 
 
 
309 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.13 
 
 
310 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.39 
 
 
309 aa  341  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.91 
 
 
308 aa  340  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  59.16 
 
 
310 aa  340  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.26 
 
 
307 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.59 
 
 
308 aa  340  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.26 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.83 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.19 
 
 
309 aa  338  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.09 
 
 
308 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.09 
 
 
308 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.38 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.26 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.06 
 
 
309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.81 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.9 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.9 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.37 
 
 
312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.81 
 
 
311 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.13 
 
 
311 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.86 
 
 
309 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.52 
 
 
308 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  62.46 
 
 
309 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.63 
 
 
308 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.56 
 
 
310 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.13 
 
 
311 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.77 
 
 
307 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  60.77 
 
 
311 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.24 
 
 
310 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.52 
 
 
309 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.96 
 
 
311 aa  332  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  60.52 
 
 
309 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.93 
 
 
311 aa  331  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.81 
 
 
311 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.28 
 
 
308 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  62.14 
 
 
309 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2426  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.1 
 
 
309 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.45 
 
 
311 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.13 
 
 
311 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.13 
 
 
311 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.13 
 
 
311 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.69 
 
 
309 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.81 
 
 
311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  59.81 
 
 
311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.47 
 
 
313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>