More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6050 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
319 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.8 
 
 
319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.83 
 
 
318 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  67.71 
 
 
318 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.75 
 
 
317 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.47 
 
 
313 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.83 
 
 
318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.75 
 
 
320 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.89 
 
 
318 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.83 
 
 
318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.83 
 
 
318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  59.87 
 
 
315 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.12 
 
 
320 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.58 
 
 
317 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.52 
 
 
314 aa  364  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.5 
 
 
317 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.77 
 
 
318 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.82 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.82 
 
 
321 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.84 
 
 
316 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.43 
 
 
320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.58 
 
 
316 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.3 
 
 
319 aa  348  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.37 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.92 
 
 
322 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.47 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.51 
 
 
321 aa  286  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.69 
 
 
316 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.29 
 
 
317 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.48 
 
 
326 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.11 
 
 
325 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.38 
 
 
317 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.64 
 
 
328 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.6 
 
 
329 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.16 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.75 
 
 
329 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.25 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02790  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.04 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.64 
 
 
326 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.85 
 
 
311 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.22 
 
 
319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.72 
 
 
325 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.27 
 
 
311 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.27 
 
 
311 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.27 
 
 
311 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  44.27 
 
 
311 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.27 
 
 
311 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.22 
 
 
311 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.79 
 
 
317 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.27 
 
 
311 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.8 
 
 
308 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.22 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.3 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.95 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.45 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  42.9 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.16 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.24 
 
 
317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.08 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.08 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.63 
 
 
309 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.09 
 
 
315 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.81 
 
 
311 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7938  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.91 
 
 
315 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.45 
 
 
311 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.78 
 
 
308 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.07 
 
 
309 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
311 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.04 
 
 
317 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.58 
 
 
309 aa  208  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.46 
 
 
325 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.67 
 
 
310 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.67 
 
 
310 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.86 
 
 
310 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.86 
 
 
310 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2134  electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.56 
 
 
317 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.85 
 
 
310 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.65 
 
 
309 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.51 
 
 
340 aa  205  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.21 
 
 
349 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.31 
 
 
309 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3680  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.72 
 
 
330 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.34 
 
 
310 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.21 
 
 
309 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.81 
 
 
313 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4306  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.73 
 
 
310 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.22 
 
 
317 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.31 
 
 
309 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.45 
 
 
329 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  43.81 
 
 
309 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.41 
 
 
310 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.53 
 
 
309 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  42.53 
 
 
309 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.69 
 
 
309 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  43.18 
 
 
309 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40 
 
 
436 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.26 
 
 
325 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.22 
 
 
443 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  41.14 
 
 
311 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.56 
 
 
313 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>