More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7803 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
309 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
311 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
311 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  65.92 
 
 
315 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.81 
 
 
311 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.13 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.13 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.48 
 
 
311 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  66.13 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.13 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.48 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.56 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.16 
 
 
311 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.81 
 
 
310 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.16 
 
 
311 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.13 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.13 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.13 
 
 
311 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.16 
 
 
311 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  64.84 
 
 
311 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.99 
 
 
308 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
313 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.65 
 
 
308 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  63.16 
 
 
327 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  67.1 
 
 
309 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.4 
 
 
309 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  64.4 
 
 
309 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.67 
 
 
310 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.67 
 
 
310 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.16 
 
 
310 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.58 
 
 
309 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  63.69 
 
 
314 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.34 
 
 
308 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.34 
 
 
310 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.1 
 
 
310 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.01 
 
 
310 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  65.37 
 
 
314 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.81 
 
 
310 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.52 
 
 
314 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.03 
 
 
310 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.33 
 
 
309 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.11 
 
 
309 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.81 
 
 
310 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.48 
 
 
310 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.48 
 
 
310 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4306  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.42 
 
 
310 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.48 
 
 
310 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.92 
 
 
309 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.52 
 
 
310 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.34 
 
 
310 aa  362  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  362  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.46 
 
 
309 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  358  9e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.17 
 
 
308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.17 
 
 
308 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.46 
 
 
309 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2092  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.24 
 
 
315 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  61.81 
 
 
311 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.84 
 
 
308 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.19 
 
 
308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.25 
 
 
309 aa  351  8e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.66 
 
 
308 aa  349  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  60 
 
 
310 aa  349  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.93 
 
 
309 aa  348  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.17 
 
 
311 aa  348  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  62.14 
 
 
309 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  59.03 
 
 
309 aa  346  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0738  electron transfer flavoprotein, subunit alpha  65.48 
 
 
311 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170682  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2640  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.99 
 
 
310 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5518  electron transfer flavoprotein subunit alpha  65.16 
 
 
310 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.87 
 
 
313 aa  345  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.98 
 
 
309 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.29 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4828  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.38 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.58 
 
 
309 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.68 
 
 
314 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.9 
 
 
311 aa  340  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.84 
 
 
309 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  63.75 
 
 
309 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.22 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
310 aa  338  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  62.46 
 
 
309 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  59.35 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.87 
 
 
308 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.17 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2549  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.16 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.93 
 
 
307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  59.55 
 
 
308 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.43 
 
 
310 aa  333  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.55 
 
 
313 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.72 
 
 
309 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.31 
 
 
309 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.28 
 
 
307 aa  332  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0794  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.48 
 
 
311 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.516944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.38 
 
 
307 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0865  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.16 
 
 
311 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0314177  normal  0.611517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>