More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3195 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  100 
 
 
309 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  79.94 
 
 
309 aa  494  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.65 
 
 
310 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.65 
 
 
310 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.9 
 
 
309 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.9 
 
 
309 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  71.9 
 
 
309 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.39 
 
 
314 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.92 
 
 
309 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.57 
 
 
309 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.48 
 
 
308 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.59 
 
 
317 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  66.45 
 
 
311 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  64.19 
 
 
310 aa  384  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  68.95 
 
 
309 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  71.24 
 
 
309 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  62.26 
 
 
314 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.16 
 
 
313 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  68.95 
 
 
309 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
313 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  67.42 
 
 
314 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.52 
 
 
310 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.74 
 
 
309 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.87 
 
 
310 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
311 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.52 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.46 
 
 
308 aa  364  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.52 
 
 
310 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  68.51 
 
 
309 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  64.19 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  69.61 
 
 
309 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  64.19 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.87 
 
 
311 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.35 
 
 
316 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.14 
 
 
312 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.69 
 
 
315 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.34 
 
 
317 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.32 
 
 
310 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.87 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.87 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.26 
 
 
309 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  61.3 
 
 
327 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.19 
 
 
309 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.4 
 
 
309 aa  362  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.13 
 
 
310 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.19 
 
 
314 aa  360  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
309 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0147  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.58 
 
 
311 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.67 
 
 
316 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.97 
 
 
308 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.11 
 
 
308 aa  358  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.75 
 
 
319 aa  358  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.97 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.52 
 
 
314 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.68 
 
 
311 aa  355  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  63.55 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.52 
 
 
310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
349 aa  355  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.26 
 
 
309 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.35 
 
 
309 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.14 
 
 
308 aa  353  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  69.28 
 
 
309 aa  353  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.97 
 
 
310 aa  353  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
309 aa  353  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
313 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
313 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  352  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.02 
 
 
311 aa  352  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  61.29 
 
 
310 aa  351  7e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.13 
 
 
310 aa  351  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.29 
 
 
308 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
309 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
309 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.03 
 
 
310 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  348  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  61.15 
 
 
314 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.9 
 
 
308 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.23 
 
 
310 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.23 
 
 
309 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  62.42 
 
 
314 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>