More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0513 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
311 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  91.32 
 
 
311 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.52 
 
 
313 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.39 
 
 
310 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  79.68 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.24 
 
 
311 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  76.45 
 
 
309 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.56 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  79.68 
 
 
310 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  75.24 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  75.56 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.56 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.56 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.56 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.42 
 
 
310 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.6 
 
 
311 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.24 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.56 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  75.24 
 
 
311 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.84 
 
 
310 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.24 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  75.24 
 
 
311 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  78.71 
 
 
310 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.24 
 
 
311 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.6 
 
 
311 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.24 
 
 
311 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.63 
 
 
311 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.39 
 
 
310 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.13 
 
 
310 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.48 
 
 
310 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.55 
 
 
310 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  72.38 
 
 
315 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  73.25 
 
 
314 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.03 
 
 
311 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.42 
 
 
310 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.19 
 
 
310 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.19 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.19 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.94 
 
 
308 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.23 
 
 
308 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  72.93 
 
 
314 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2640  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.74 
 
 
310 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  70.59 
 
 
327 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0738  electron transfer flavoprotein, subunit alpha  77.49 
 
 
311 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170682  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5518  electron transfer flavoprotein subunit alpha  77.1 
 
 
310 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.97 
 
 
309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4306  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.74 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  71.61 
 
 
311 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2092  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.29 
 
 
315 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0865  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  79.42 
 
 
311 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0314177  normal  0.611517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.81 
 
 
309 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  68.73 
 
 
314 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.94 
 
 
308 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  69.81 
 
 
309 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0924  electron transfer flavoprotein subunit alpha  79.1 
 
 
311 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  69.81 
 
 
309 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  71.29 
 
 
309 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.13 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.13 
 
 
309 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2549  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.21 
 
 
311 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0794  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.46 
 
 
311 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.516944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.71 
 
 
309 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.35 
 
 
310 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  65.81 
 
 
310 aa  388  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.96 
 
 
309 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  70.13 
 
 
309 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.56 
 
 
314 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  71.29 
 
 
309 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  71.75 
 
 
309 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.77 
 
 
310 aa  378  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
309 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  71.24 
 
 
309 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.42 
 
 
312 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.1 
 
 
309 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.1 
 
 
309 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.74 
 
 
309 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.97 
 
 
310 aa  374  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
310 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  63.67 
 
 
314 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.48 
 
 
313 aa  371  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
309 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
309 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
349 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.52 
 
 
308 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.87 
 
 
310 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
319 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.2 
 
 
310 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.74 
 
 
309 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
309 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.06 
 
 
310 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.81 
 
 
309 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.15 
 
 
309 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.09 
 
 
317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.48 
 
 
314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  66.24 
 
 
314 aa  361  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.52 
 
 
309 aa  361  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1038  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.68 
 
 
309 aa  361  9e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.434498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.23 
 
 
313 aa  360  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4828  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.71 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.34 
 
 
309 aa  358  6e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>