More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1439 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
322 aa  609  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.29 
 
 
318 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  65.12 
 
 
318 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.53 
 
 
318 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.53 
 
 
318 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.53 
 
 
318 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.16 
 
 
317 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.77 
 
 
318 aa  358  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.92 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.91 
 
 
318 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.23 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.99 
 
 
319 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.66 
 
 
317 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.92 
 
 
319 aa  325  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
316 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.13 
 
 
321 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.52 
 
 
317 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.73 
 
 
315 aa  322  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  56.21 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.62 
 
 
313 aa  315  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.62 
 
 
314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.6 
 
 
320 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.79 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.21 
 
 
320 aa  293  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.52 
 
 
316 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.46 
 
 
317 aa  279  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  49.84 
 
 
321 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.47 
 
 
316 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.06 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02790  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  49.52 
 
 
345 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.71 
 
 
317 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.99 
 
 
325 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.15 
 
 
322 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44 
 
 
317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.46 
 
 
329 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.24 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.37 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.82 
 
 
325 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.82 
 
 
325 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  38.82 
 
 
325 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.51 
 
 
325 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.82 
 
 
325 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40 
 
 
319 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.51 
 
 
325 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.51 
 
 
325 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.51 
 
 
325 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.51 
 
 
325 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.51 
 
 
325 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.25 
 
 
309 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.88 
 
 
329 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.1 
 
 
340 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.98 
 
 
328 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.69 
 
 
325 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.37 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.25 
 
 
441 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.23 
 
 
410 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40 
 
 
439 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.13 
 
 
325 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.68 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.99 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.88 
 
 
442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.24 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.3 
 
 
442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.5 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.43 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.3 
 
 
308 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.24 
 
 
349 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4639  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.41 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.04 
 
 
441 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.78 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.77 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.03 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0545  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.54 
 
 
308 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.68 
 
 
309 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  47.53 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.93 
 
 
312 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.79 
 
 
443 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  45.49 
 
 
321 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.53 
 
 
308 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.92 
 
 
309 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.39 
 
 
313 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.27 
 
 
436 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.62 
 
 
312 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.4 
 
 
313 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.06 
 
 
311 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.06 
 
 
311 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.69 
 
 
316 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.87 
 
 
309 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.06 
 
 
311 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.74 
 
 
311 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.74 
 
 
311 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.45 
 
 
317 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  39.74 
 
 
311 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40 
 
 
311 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  40.06 
 
 
311 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.74 
 
 
311 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.74 
 
 
311 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.74 
 
 
311 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>