More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0257 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
314 aa  617  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  79.3 
 
 
313 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.61 
 
 
317 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.52 
 
 
316 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  67.82 
 
 
317 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.51 
 
 
316 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.38 
 
 
320 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.43 
 
 
320 aa  364  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.41 
 
 
319 aa  359  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.82 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  60.74 
 
 
318 aa  351  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.19 
 
 
321 aa  349  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.01 
 
 
320 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.25 
 
 
317 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.37 
 
 
317 aa  341  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.52 
 
 
319 aa  336  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.19 
 
 
319 aa  331  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.87 
 
 
319 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.68 
 
 
318 aa  329  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.18 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.81 
 
 
318 aa  318  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.74 
 
 
318 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.74 
 
 
318 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.74 
 
 
318 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.74 
 
 
318 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.31 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.63 
 
 
321 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.1 
 
 
317 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.75 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.3 
 
 
329 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.99 
 
 
329 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.65 
 
 
326 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.98 
 
 
328 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3680  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.32 
 
 
330 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.2 
 
 
317 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.06 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.75 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.99 
 
 
326 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02790  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.11 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  44.62 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.62 
 
 
317 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.72 
 
 
313 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.99 
 
 
311 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.94 
 
 
316 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.33 
 
 
317 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  44.06 
 
 
320 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.68 
 
 
311 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.68 
 
 
311 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  42.68 
 
 
311 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.68 
 
 
311 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.68 
 
 
311 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.68 
 
 
311 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
309 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.81 
 
 
311 aa  205  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.49 
 
 
311 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.85 
 
 
311 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  43.35 
 
 
314 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4639  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.65 
 
 
325 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.36 
 
 
311 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.71 
 
 
322 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.17 
 
 
311 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.94 
 
 
317 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  41.99 
 
 
311 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.44 
 
 
325 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.22 
 
 
315 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.67 
 
 
311 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.67 
 
 
311 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.95 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.72 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.13 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.44 
 
 
307 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.35 
 
 
308 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.19 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.04 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.72 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.85 
 
 
314 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.99 
 
 
308 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.89 
 
 
410 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  39.14 
 
 
341 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.29 
 
 
309 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.35 
 
 
308 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  41.01 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.96 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.96 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.13 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.59 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.96 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.26 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.96 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.48 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.91 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.59 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  43.59 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.61 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.42 
 
 
308 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.96 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.37 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.53 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.92 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>