More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0685 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
321 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.44 
 
 
317 aa  332  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.18 
 
 
320 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.56 
 
 
317 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55 
 
 
313 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.05 
 
 
316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.99 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  50.47 
 
 
317 aa  309  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.21 
 
 
319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.17 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.9 
 
 
319 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.04 
 
 
315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.04 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.83 
 
 
319 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.25 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  52.81 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.25 
 
 
318 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.31 
 
 
321 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.44 
 
 
318 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.44 
 
 
318 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.44 
 
 
318 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.22 
 
 
317 aa  285  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.56 
 
 
318 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.14 
 
 
319 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  49.37 
 
 
317 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.12 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.31 
 
 
316 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.11 
 
 
317 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.22 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.99 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.57 
 
 
329 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.18 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.41 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.73 
 
 
329 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.56 
 
 
325 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.06 
 
 
329 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.21 
 
 
322 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.38 
 
 
327 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.25 
 
 
317 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.94 
 
 
325 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.32 
 
 
325 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  39.32 
 
 
325 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.32 
 
 
325 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.32 
 
 
325 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.36 
 
 
307 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.25 
 
 
325 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.32 
 
 
325 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.01 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.01 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.01 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.01 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.32 
 
 
325 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  41.8 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.36 
 
 
308 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.86 
 
 
410 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.51 
 
 
330 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.8 
 
 
308 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.8 
 
 
308 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.65 
 
 
448 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.6 
 
 
326 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.55 
 
 
436 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.17 
 
 
443 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.64 
 
 
308 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.08 
 
 
308 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  39.47 
 
 
341 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.4 
 
 
309 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.99 
 
 
340 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.15 
 
 
442 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.51 
 
 
325 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.08 
 
 
308 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.32 
 
 
308 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3680  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.69 
 
 
330 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.21 
 
 
307 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.14 
 
 
308 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.58 
 
 
441 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.32 
 
 
308 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.28 
 
 
447 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.69 
 
 
307 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.53 
 
 
439 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02790  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.76 
 
 
345 aa  203  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.91 
 
 
308 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.12 
 
 
310 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0654  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.06 
 
 
327 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.56 
 
 
452 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.35 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.28 
 
 
447 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.08 
 
 
443 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.56 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.91 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.44 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.42 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.47 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.09 
 
 
441 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  40.57 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.91 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.95 
 
 
452 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.44 
 
 
312 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.58 
 
 
307 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.57 
 
 
317 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.8 
 
 
313 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>