52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3108 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3108  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  44.21 
 
 		 235 aa  168  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  32.63 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  35.14 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  33.05 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.48 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  31.36 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  43.59 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  36.52 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  42 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  39.52 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  38.93 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  39.34 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  31.12 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  32.52 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  42.06 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  41.28 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  35.96 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  31.61 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  33.99 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  40.57 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  40.57 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  40.57 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  29.45 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  36.28 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  41.18 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  33.56 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  34.78 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1023  hypothetical protein  36.89 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109321  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  30.47 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  32.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  33.56 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  28.35 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  28.87 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  34.42 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  36.54 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  29.49 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  33.77 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4400  hypothetical protein  33.08 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2540  hypothetical protein  36.45 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  33.77 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  34.19 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  36.04 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  29.63 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  28.08 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  26.56 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  26.99 
 
 		 266 aa  41.2  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>