10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1023 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  490  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0493  hypothetical protein  57.09 
 
 		 245 aa  284  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0469  hypothetical protein  56.68 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1209  hypothetical protein  27.52 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0190784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1363  hypothetical protein  23.32 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0109  hypothetical protein  26.17 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  27.62 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  29.51 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  28.96 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  38.54 
 
 		 235 aa  45.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>