23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0493 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0469  hypothetical protein  74.69 
 
 		 245 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1023  hypothetical protein  57.09 
 
 		 244 aa  284  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1209  hypothetical protein  30.36 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0190784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0109  hypothetical protein  28.64 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  30.5 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1363  hypothetical protein  23.51 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  29.89 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  24.82 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  38.36 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  29.94 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  25.65 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  27.98 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  31.91 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  31.43 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  26.79 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  23.46 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  30.16 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  29.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  30.59 
 
 		 272 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>