108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2540 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2540  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.533179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3873  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  65.61 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.4 
 
 
268 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1780  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.21 
 
 
274 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.253788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3758  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.05 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.23 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.69 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1800  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.57 
 
 
280 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2737  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.52 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  decreased coverage  0.00114829 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2661  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.12 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.518214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.6 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.815956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.05 
 
 
607 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0188  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.71 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.620509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0230  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1757  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.34 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.05 
 
 
607 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19720  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.87 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.65 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.78 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.05 
 
 
607 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.05 
 
 
607 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.67 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2276  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.6 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295611  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.27 
 
 
631 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1556  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.08 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.449273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0972  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.54 
 
 
319 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.701633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.89 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2929  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.02 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000223394  hitchhiker  0.00000900382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2152  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.74 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.56 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000121711 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4812  predicted protein  27.24 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0071  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.31 
 
 
607 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.59 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3590  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.74 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.36 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.38 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.772379 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.81 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  27.44 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  27.55 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3768  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.7 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0487365  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.84 
 
 
594 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.33 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84114  hypothetical protein  37.93 
 
 
1213 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0940196 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.12 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3045  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.43 
 
 
226 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1359  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.18 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.59 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1170  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.03 
 
 
222 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2170  putative phosphodiesterase  28.3 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1669  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.74 
 
 
238 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.93 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0834008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.95 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4734  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.45 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4820  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.45 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00201723  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5119  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.45 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7586  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.33 
 
 
335 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.2 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4047  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.64 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.66 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15710  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.04 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.813483  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.14 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.42 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.23 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1894  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.77 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637186  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0885  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.81 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0088343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.99 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5315  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.11 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565842  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.81 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0569  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.13 
 
 
227 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.16 
 
 
460 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.83 
 
 
220 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.94 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1345  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  21.15 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.79 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.0753834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.99 
 
 
293 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00137  glycerophosphocholine phosphodiesterase Gde1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11590)  43.86 
 
 
1205 aa  45.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.962867  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.13 
 
 
250 aa  45.4  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  30.67 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1697  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.14 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.66 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115682  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0507  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.04 
 
 
616 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.949943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0629  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.28 
 
 
623 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.544167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.28 
 
 
623 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.831779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  46.3 
 
 
416 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1584  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.09 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15940  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.43 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.1 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.77 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.32 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  21.94 
 
 
600 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.91 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0961804  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.21 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0913  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.59 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0505  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.36 
 
 
623 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3762  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.57 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.36 
 
 
623 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0502  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.36 
 
 
623 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0504  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.36 
 
 
623 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3150  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.4 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>