28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2207 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2207  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  302  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932565  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  46.85 
 
 
405 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  38.1 
 
 
617 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  30.93 
 
 
470 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  30.61 
 
 
353 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  36.94 
 
 
650 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  34.31 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  34.69 
 
 
365 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  32.35 
 
 
349 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  34.55 
 
 
349 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  33.96 
 
 
375 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  32.98 
 
 
378 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  33.33 
 
 
539 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  31.18 
 
 
394 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  34.02 
 
 
379 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  28.7 
 
 
386 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  37.23 
 
 
371 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  33.33 
 
 
360 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  31.25 
 
 
341 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  27.62 
 
 
370 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  29.25 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  31.63 
 
 
458 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  33.02 
 
 
320 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  27.96 
 
 
391 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  33.67 
 
 
363 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  31.58 
 
 
375 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  28.43 
 
 
377 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  28.7 
 
 
406 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>