More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3087 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3087  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
650 aa  1275    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8518  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  51.55 
 
 
658 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853997  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2173  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.54 
 
 
662 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.99 
 
 
637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  32.67 
 
 
672 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
518 aa  107  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 
518 aa  107  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0511  family 2 glycosyl transferase  31.94 
 
 
586 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.287818  normal  0.265278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
520 aa  97.8  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
573 aa  94.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
573 aa  94.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1424  glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
385 aa  86.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26500  glycosyl transferase  28.3 
 
 
632 aa  85.1  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  30.77 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.04 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  34.57 
 
 
946 aa  78.2  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  36.75 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  31.34 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  36.44 
 
 
344 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14580  glycosyl transferase  27.13 
 
 
636 aa  76.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  35.9 
 
 
344 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.12 
 
 
322 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  36.44 
 
 
344 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  35.9 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  29.25 
 
 
321 aa  76.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  35.9 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  35.9 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  35.9 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  35.9 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  36.44 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  36.44 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  35.59 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
348 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
329 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
1116 aa  72  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  27.4 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  26.57 
 
 
1157 aa  71.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  38.66 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.29 
 
 
616 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  27.81 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  28.72 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  31.3 
 
 
329 aa  67  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
309 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  30.54 
 
 
785 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0716  putative sugar transferase  22.58 
 
 
448 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.92 
 
 
941 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
334 aa  66.6  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  24.88 
 
 
346 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.39 
 
 
1148 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
358 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  32.28 
 
 
301 aa  66.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
384 aa  66.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  35.54 
 
 
300 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.29 
 
 
323 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
760 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
325 aa  64.3  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  22.96 
 
 
326 aa  64.3  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  25 
 
 
1173 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.15 
 
 
329 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.15 
 
 
329 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  22.56 
 
 
355 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  24.4 
 
 
697 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  26.17 
 
 
358 aa  62.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  40 
 
 
316 aa  62  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
358 aa  62.4  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
369 aa  62  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
324 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0481  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.95 
 
 
351 aa  61.2  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  33.83 
 
 
343 aa  61.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
322 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
386 aa  60.8  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
312 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  24.03 
 
 
325 aa  60.5  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  27.75 
 
 
354 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 
304 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
1015 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
884 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  26.97 
 
 
346 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
343 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
264 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
341 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
1032 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09810  glycosyl transferase  26.73 
 
 
405 aa  58.9  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
379 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11531  glycosyltransferase  33.96 
 
 
342 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.365378 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.79 
 
 
334 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
1032 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  38.1 
 
 
418 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  30.28 
 
 
970 aa  58.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  32.5 
 
 
349 aa  57.8  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  40.62 
 
 
310 aa  57.4  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  39.13 
 
 
309 aa  57.4  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
348 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
336 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>