More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2173 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2173  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 
662 aa  1338    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3087  family 2 glycosyl transferase  32.58 
 
 
650 aa  197  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  39.07 
 
 
637 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8518  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.15 
 
 
658 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853997  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  37.54 
 
 
672 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
518 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
518 aa  167  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
573 aa  150  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
573 aa  150  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
520 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26500  glycosyl transferase  32.26 
 
 
632 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234854  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1424  glycosyltransferase-like protein  28.75 
 
 
385 aa  126  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  34.85 
 
 
1173 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.06 
 
 
946 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.8 
 
 
941 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.35 
 
 
322 aa  100  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0511  family 2 glycosyl transferase  30.75 
 
 
586 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.287818  normal  0.265278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.75 
 
 
1157 aa  99  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  32.08 
 
 
386 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
329 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32 
 
 
729 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.92 
 
 
1168 aa  93.6  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.82 
 
 
970 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14580  glycosyl transferase  35.47 
 
 
636 aa  92  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  25.07 
 
 
334 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
384 aa  89.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  30.49 
 
 
731 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  29.86 
 
 
1169 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  31.73 
 
 
321 aa  89.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.78 
 
 
334 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  28.51 
 
 
353 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.46 
 
 
329 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.13 
 
 
1148 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.46 
 
 
329 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  34.23 
 
 
785 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.01 
 
 
616 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.66 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  28.94 
 
 
349 aa  84  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.89 
 
 
326 aa  84  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
335 aa  83.2  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
366 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.1 
 
 
323 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
341 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2178  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.25 
 
 
952 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
334 aa  80.1  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
376 aa  80.1  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
334 aa  80.5  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
289 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  39.17 
 
 
319 aa  79.7  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  26.94 
 
 
301 aa  79.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
351 aa  79.7  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.82 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  26.39 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  27.57 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
324 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  28.57 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.71 
 
 
326 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
340 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  31.4 
 
 
325 aa  73.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.06 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.09 
 
 
326 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.96 
 
 
326 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.05 
 
 
325 aa  73.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
291 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  42.42 
 
 
301 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  29.95 
 
 
343 aa  72  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
1116 aa  72  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  31.67 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  31.67 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.73 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
358 aa  70.1  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  45.26 
 
 
362 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.83 
 
 
295 aa  70.5  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
327 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
328 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
358 aa  70.5  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1193  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 
871 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  29.17 
 
 
1157 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
209 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09810  glycosyl transferase  26.43 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
884 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>