36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3033 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3033  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1234    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.627155  normal  0.211412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8441  hypothetical protein  74.48 
 
 		 615 aa  926    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8439  hypothetical protein  51.76 
 
 		 744 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3031  hypothetical protein  54.17 
 
 		 837 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.711635  normal  0.153146 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5576  hypothetical protein  30.72 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4634  hypothetical protein  33.21 
 
 		 268 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2955  hypothetical protein  42.77 
 
 		 774 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5488  hypothetical protein  31.28 
 
 		 587 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5888  hypothetical protein  31.28 
 
 		 587 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5517  hypothetical protein  28.05 
 
 		 591 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2149  hypothetical protein  38.25 
 
 		 682 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1979  hypothetical protein  38.46 
 
 		 733 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6403  hypothetical protein  35.33 
 
 		 590 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233241  normal  0.0445002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4635  sigma-70 region 4 domain protein  34.69 
 
 		 289 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2278  sigma-70 region 4 domain-containing protein  25.64 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3785  RNA polymerase sigma factor SigB  34.21 
 
 		 334 aa  47.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0872543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12724  RNA polymerase sigma factor SigB  37.66 
 
 		 345 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24480  RNA polymerase sigma factor SigB  36.36 
 
 		 342 aa  47.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0306487  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2177  RNA polymerase sigma factor SigB  36.36 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2166  RNA polymerase sigma factor SigB  36.36 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407173  hitchhiker  0.00170553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2223  RNA polymerase sigma factor SigB  36.36 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1081  RNA polymerase sigma factor RpoD  36.14 
 
 		 622 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2451  RNA polymerase sigma factor SigB  36.36 
 
 		 329 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449528  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1019  RNA polymerase sigma factor RpoD  36.14 
 
 		 622 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0406666  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1021  RNA polymerase sigma factor RpoD  36.14 
 
 		 625 aa  45.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3948  RNA polymerase sigma factor SigB  36.36 
 
 		 329 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0788  RNA polymerase sigma factor RpoD  36.14 
 
 		 622 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.101684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1493  RNA polymerase sigma factor SigB  31.63 
 
 		 330 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_17029  predicted protein  38.67 
 
 		 329 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.698302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1315  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  40.98 
 
 		 413 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  44.83 
 
 		 367 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0824  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  36.49 
 
 		 455 aa  44.3  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00671165  hitchhiker  0.000482481 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0715  RNA polymerase sigma factor RpoD  34.88 
 
 		 624 aa  44.3  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0521  RNA polymerase sigma factor RpoD  43.33 
 
 		 623 aa  44.3  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.981819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  39.74 
 
 		 369 aa  43.9  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2238  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  32.53 
 
 		 337 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0708538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>