11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6403 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6403  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1152    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233241  normal  0.0445002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2149  hypothetical protein  66.57 
 
 		 682 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1979  hypothetical protein  40.93 
 
 		 733 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2955  hypothetical protein  45.67 
 
 		 774 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3031  hypothetical protein  29.02 
 
 		 837 aa  120  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.711635  normal  0.153146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8439  hypothetical protein  26.04 
 
 		 744 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8441  hypothetical protein  35.48 
 
 		 615 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3033  hypothetical protein  35.33 
 
 		 621 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.627155  normal  0.211412 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  32.8 
 
 		 304 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1424  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4272  hypothetical protein  41.74 
 
 		 1776 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>