11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8439 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8439  hypothetical protein  100 
 
 		 744 aa  1456    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3031  hypothetical protein  51.63 
 
 		 837 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.711635  normal  0.153146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2955  hypothetical protein  28.09 
 
 		 774 aa  207  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3033  hypothetical protein  51.76 
 
 		 621 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.627155  normal  0.211412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8441  hypothetical protein  45.4 
 
 		 615 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2149  hypothetical protein  28.41 
 
 		 682 aa  124  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6403  hypothetical protein  27.25 
 
 		 590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233241  normal  0.0445002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1979  hypothetical protein  33.16 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704553  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5488  hypothetical protein  32.89 
 
 		 587 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5888  hypothetical protein  32.89 
 
 		 587 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.95 
 
 		 2914 aa  48.5  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>