161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1931 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1931  asparaginase  100 
 
 
341 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0724  peptidase T2 asparaginase 2  41.92 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0974  peptidase T2 asparaginase 2  36.33 
 
 
274 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  44.62 
 
 
300 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  43.03 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  37.5 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  37.5 
 
 
313 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  37.5 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  37.5 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0839  Asparaginase  38.16 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1503  asparaginase  38.87 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.606949  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  37.18 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  39.37 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2284  asparaginase  36.05 
 
 
301 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  37.64 
 
 
311 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  37.31 
 
 
348 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0874  Asparaginase  38.23 
 
 
299 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0555  peptidase T2 asparaginase 2  40.22 
 
 
283 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  36.26 
 
 
312 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  37.87 
 
 
312 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0343  asparaginase  39.02 
 
 
334 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.303998  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  36.3 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  41.31 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  32.59 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  38.85 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  36.09 
 
 
361 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4831  peptidase T2 asparaginase 2  39.15 
 
 
292 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  36.3 
 
 
321 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  36.3 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  36.3 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  36.3 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2511  asparaginase  38.29 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1774  peptidase T2 asparaginase 2  34.78 
 
 
315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  37.37 
 
 
320 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0104  asparaginase  40.07 
 
 
325 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203772  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2366  peptidase T2, asparaginase 2  42.69 
 
 
300 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.532674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  39.06 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  35.47 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  35.47 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  36.86 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  35.66 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0841  peptidase T2, asparaginase 2  37.85 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0241513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  35.47 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  35.91 
 
 
352 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  31.52 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  34.51 
 
 
344 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  37.13 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  38.17 
 
 
315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  37.45 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1000  peptidase T2, asparaginase 2  37.93 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.918613  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13940  asparaginase  39.53 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.885662  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  40.62 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  38.67 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  34.66 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1012  peptidase T2 asparaginase 2  37.64 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5681  peptidase T2 asparaginase 2  31.82 
 
 
307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  34.77 
 
 
306 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  38.25 
 
 
339 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  38.3 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  39.53 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  34.8 
 
 
353 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2882  peptidase T2 asparaginase 2  38.67 
 
 
300 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.562831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  36.77 
 
 
335 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  35.41 
 
 
343 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  33.58 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  34.66 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  34.12 
 
 
363 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  40.3 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4448  peptidase T2 asparaginase 2  33.73 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1369  peptidase T2 asparaginase 2  39.53 
 
 
307 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.910347  normal  0.265326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01618  N(4)-(Beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase (Glycosylasparaginase) (Aspartylglucosaminidase) (N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)-L-asparagine amidase) (AGA)  33.99 
 
 
389 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.649932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  38.04 
 
 
320 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  37.09 
 
 
320 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  33.58 
 
 
313 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  36.86 
 
 
338 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  34.33 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2941  Beta-aspartyl-peptidase  38.15 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  32.31 
 
 
356 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  33.07 
 
 
343 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1892  peptidase T2, asparaginase 2  33.56 
 
 
301 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  33.07 
 
 
326 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  32.68 
 
 
343 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  33.07 
 
 
326 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01470  asparaginase  36.4 
 
 
307 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.666987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  32.68 
 
 
343 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5802  Asparaginase  34.64 
 
 
290 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160809  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  34.07 
 
 
315 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  33.46 
 
 
343 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0025  asparaginase  37.9 
 
 
287 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  34.07 
 
 
315 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0908  peptidase T2, asparaginase 2  38.55 
 
 
299 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0970  asparaginase  39.29 
 
 
299 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  39 
 
 
328 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0550  peptidase T2, asparaginase 2  36.5 
 
 
308 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  33.07 
 
 
343 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  35.38 
 
 
354 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  32.68 
 
 
343 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  37.13 
 
 
319 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  39.62 
 
 
325 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6563  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  33.1 
 
 
350 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>