More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1547 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1547  Glutamate--ammonia ligase  100 
 
 
347 aa  719    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000126945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1635  glutamine synthetase, type I  46.33 
 
 
456 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1449  glutamine synthetase, type I  43.81 
 
 
456 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1787  glutamate--ammonia ligase  42.12 
 
 
477 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.683102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  39.56 
 
 
474 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  39.25 
 
 
474 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  39.25 
 
 
474 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  38.63 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 
473 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  37.22 
 
 
473 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  37.22 
 
 
473 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  36.02 
 
 
471 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  36.91 
 
 
473 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  36.68 
 
 
473 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  36.79 
 
 
473 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  36.59 
 
 
473 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  36.91 
 
 
473 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  38.91 
 
 
474 aa  202  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  36.28 
 
 
473 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  36.22 
 
 
469 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  36.59 
 
 
473 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  37.03 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  37.03 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  37.99 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  36.51 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  38.1 
 
 
474 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  37.74 
 
 
475 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  36.91 
 
 
473 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03568  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 
467 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  36.83 
 
 
470 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  36.51 
 
 
470 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  36.1 
 
 
469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  35.58 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  36.88 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  35.62 
 
 
472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0798  glutamine synthetase, type I  35.91 
 
 
476 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0671086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  35.35 
 
 
474 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0722  glutamine synthetase, type I  35.91 
 
 
476 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000425202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
467 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  35.03 
 
 
469 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  36.88 
 
 
471 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0109  glutamine synthetase, type I  35 
 
 
469 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1307  glutamine synthetase, type I  35.91 
 
 
476 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00102635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  38.34 
 
 
474 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  36.25 
 
 
471 aa  195  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  37.26 
 
 
474 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  35.94 
 
 
469 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1124  glutamate--ammonia ligase  35.63 
 
 
469 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  37.06 
 
 
474 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  35.78 
 
 
469 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  35.78 
 
 
469 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  36.66 
 
 
470 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  37.27 
 
 
478 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  36.25 
 
 
469 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  36.98 
 
 
479 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  35.31 
 
 
467 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1109  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  37.54 
 
 
477 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  34.07 
 
 
473 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  38.31 
 
 
486 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  36.56 
 
 
471 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  34.07 
 
 
477 aa  192  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  37.26 
 
 
474 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  36.02 
 
 
470 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  36.22 
 
 
476 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 
469 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  38.82 
 
 
474 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  35.43 
 
 
473 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  36.74 
 
 
474 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  37.58 
 
 
474 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1661  glutamine synthetase, type I  36.53 
 
 
476 aa  192  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000859271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  36.02 
 
 
470 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  37.38 
 
 
468 aa  192  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  36.54 
 
 
470 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  36.34 
 
 
470 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  37.97 
 
 
469 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  35.96 
 
 
469 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  36.56 
 
 
471 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 
491 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 
469 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  38.82 
 
 
474 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  37.42 
 
 
478 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  36.25 
 
 
469 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  38.59 
 
 
475 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 
471 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 
469 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  33.86 
 
 
473 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>