65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0421 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0421  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00171889  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1820  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  53.17 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00552439  normal  0.470118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2582  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  37.97 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00833536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2575  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  37.97 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00380235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2568  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  37.97 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0146669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2053  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.98 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02159  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.31 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1889  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  35.38 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.105757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0508  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.19 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2341  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.47 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2501  HAD family hydrolase YedP  38.66 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2848  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.46 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2128  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  36.67 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  32.31 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1773  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.19 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2602  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.07 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370831  normal  0.0340144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2162  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.04 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0501  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.64 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.46 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2545  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.85 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3208  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.58 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2149  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.08 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0107149  normal  0.0107752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2733  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.74 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000138935  normal  0.573407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1078  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.36 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000130246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1229  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.36 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000280677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1688  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.36 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570883  decreased coverage  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2188  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.36 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1694  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  35.36 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000333785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2203  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.7 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0526685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1133  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.7 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2145  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.56 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00208109  normal  0.0800386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1254  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.59 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0460997  normal  0.891448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0736  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.59 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1144  HAD-superfamily hydrolase  29.46 
 
 		 694 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.191056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1174  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  29.46 
 
 		 694 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0053101  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1363  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  29.05 
 
 		 694 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0011007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09151  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.76 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0247  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.76 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.344605  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06761  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  25.48 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.41911 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2605  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.88 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.68 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0839  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  25.1 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00773079  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08961  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  24.9 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.192004  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10431  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  23.26 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08981  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  24.9 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.67778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.07 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.5 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  25.23 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.64 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  26.73 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.64 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  26.13 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  25.42 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.52 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  23.66 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  32.32 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  20.73 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  32.32 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  32.32 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  24 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  27.16 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  38.67 
 
 		 266 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  25.21 
 
 		 284 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>