64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2602 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2602  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  100 
 
 
271 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370831  normal  0.0340144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0508  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  50.94 
 
 
287 aa  292  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2848  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  49.82 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2162  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  49.08 
 
 
274 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02159  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  48.31 
 
 
269 aa  265  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1773  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  40.3 
 
 
273 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3208  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  37.97 
 
 
277 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2582  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  38.01 
 
 
266 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00833536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2575  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  38.01 
 
 
266 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00380235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2568  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  38.01 
 
 
266 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0146669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.98 
 
 
312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1889  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  37.36 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0736  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.96 
 
 
272 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  34.08 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2341  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.45 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2053  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.7 
 
 
274 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0501  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.33 
 
 
277 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0421  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.07 
 
 
259 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00171889  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_002936  DET1363  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  31.54 
 
 
694 aa  135  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0011007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1144  HAD-superfamily hydrolase  30.82 
 
 
694 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.191056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2545  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.57 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100234  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1174  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  30.82 
 
 
694 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0053101  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2501  HAD family hydrolase YedP  33.21 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1820  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.56 
 
 
260 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00552439  normal  0.470118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2128  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  34.44 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2203  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.73 
 
 
271 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0526685  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2145  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.16 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00208109  normal  0.0800386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2149  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0107149  normal  0.0107752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1133  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
271 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1078  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
271 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000130246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1694  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  30.51 
 
 
271 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000333785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2188  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258939  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1688  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570883  decreased coverage  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1229  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
271 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000280677  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2733  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
271 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000138935  normal  0.573407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1254  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.58 
 
 
278 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0460997  normal  0.891448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0247  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.01 
 
 
269 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.344605  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09151  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.48 
 
 
266 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10431  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.07 
 
 
266 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2605  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.6 
 
 
263 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0839  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.04 
 
 
265 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00773079  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.76 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08961  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.35 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.192004  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08981  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.78 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.67778  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06761  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.36 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.41911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  23.29 
 
 
270 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  23.92 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  23.51 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  20.7 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  21.15 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  23.62 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  23.26 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  22.56 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  25.19 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  23.69 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  22.84 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  20.95 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.63 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  21.84 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  22.22 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.99 
 
 
283 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  26.67 
 
 
222 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>