70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0508 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0508  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  100 
 
 
287 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2602  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  50.94 
 
 
271 aa  292  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370831  normal  0.0340144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2848  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  46.45 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02159  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  47.76 
 
 
269 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2162  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  44.78 
 
 
274 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1773  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  41.64 
 
 
273 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2575  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  39.25 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00380235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2568  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  39.25 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0146669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2582  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  39.25 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00833536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  39.1 
 
 
312 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3208  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.34 
 
 
277 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0736  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.16 
 
 
272 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  36.19 
 
 
269 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1889  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  36.53 
 
 
271 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.105757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2053  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  37.45 
 
 
274 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1144  HAD-superfamily hydrolase  31.79 
 
 
694 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.191056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1363  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  32.14 
 
 
694 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0011007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2341  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.13 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0421  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.19 
 
 
259 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00171889  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1174  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  31.07 
 
 
694 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0053101  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2501  HAD family hydrolase YedP  34.43 
 
 
267 aa  139  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0501  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.51 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2128  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  33.21 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2545  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.33 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100234  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1133  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.21 
 
 
271 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2145  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.21 
 
 
271 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00208109  normal  0.0800386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2149  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.21 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0107149  normal  0.0107752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1820  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.99 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00552439  normal  0.470118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2203  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.85 
 
 
271 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0526685  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1254  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.75 
 
 
278 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0460997  normal  0.891448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2188  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32 
 
 
271 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258939  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1688  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32 
 
 
271 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570883  decreased coverage  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1078  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.64 
 
 
271 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000130246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1229  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.64 
 
 
271 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000280677  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2733  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.64 
 
 
271 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000138935  normal  0.573407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1694  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  30.69 
 
 
271 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000333785  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2605  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.14 
 
 
263 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06761  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.03 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.41911 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10431  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.57 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08981  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.65 
 
 
265 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.67778  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.37 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0839  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.32 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00773079  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08961  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.57 
 
 
265 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.192004  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09151  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.8 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0247  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.29 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.344605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  21.77 
 
 
284 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  27.68 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.44 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  24.51 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  23.72 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.13 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  26.24 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  25.91 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.62 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  24.39 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  31.15 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1231  Cof-like hydrolase  23.24 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0803  HAD-superfamily cof-like hydrolase  23.05 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  35.71 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  33.77 
 
 
274 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  24.81 
 
 
226 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  33.77 
 
 
274 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3311  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.03 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000227592  normal  0.0451288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>