27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1020 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1020  dicarboxylate transporter, periplasmic dicarboxylate-binding protein, putative  100 
 
 		 342 aa  700    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2672  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.5 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3577  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.42 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.71868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3612  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.68 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00839083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0440  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  18.55 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4090  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  20.07 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4122  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  19.71 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.490315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3979  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  20.07 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0466  periplasmic C4-dicarboxylate binding protein DctP  28.76 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0789  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.45 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3074  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.3 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000735359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3301  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.97 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1051  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.79 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0900  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.47 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3078  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.18 
 
 		 465 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000806193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4242  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.73 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3168  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.41 
 
 		 464 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000659568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1169  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  20.67 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1203  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  20.48 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1187  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.7 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246361  normal  0.126569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3104  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.68 
 
 		 554 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000165592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1883  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.67 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1114  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.86 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3157  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  20.57 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0762  C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component  23.12 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3454  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.19 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3447  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  20.43 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.890437  normal  0.0946211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>