58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0406 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  63.04 
 
 
536 aa  687    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1100    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  38.52 
 
 
510 aa  346  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  37.89 
 
 
516 aa  341  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  37.96 
 
 
515 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  39.37 
 
 
508 aa  329  8e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  38.95 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  38.38 
 
 
517 aa  327  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  39.47 
 
 
514 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  35.38 
 
 
523 aa  321  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  35.74 
 
 
531 aa  320  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  36.87 
 
 
515 aa  316  8e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  39.48 
 
 
507 aa  316  8e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  35.87 
 
 
519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  38.55 
 
 
509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  35.26 
 
 
521 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  37.48 
 
 
517 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  36.02 
 
 
522 aa  310  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  37.48 
 
 
505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  36.45 
 
 
521 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  37.48 
 
 
505 aa  302  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  34.57 
 
 
525 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  36.6 
 
 
505 aa  299  7e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  37.85 
 
 
505 aa  299  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  37.99 
 
 
515 aa  298  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  36.19 
 
 
520 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  36.67 
 
 
514 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  35.77 
 
 
516 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  35.99 
 
 
505 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  37.73 
 
 
569 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  36.85 
 
 
505 aa  293  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  36.31 
 
 
516 aa  293  6e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  34.44 
 
 
527 aa  291  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  37.2 
 
 
505 aa  289  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  35.74 
 
 
514 aa  286  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  35.47 
 
 
521 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  36.3 
 
 
505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  34.39 
 
 
519 aa  283  7.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  35.24 
 
 
517 aa  281  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  35.62 
 
 
505 aa  277  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  34.25 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  34.7 
 
 
519 aa  266  5e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  35.32 
 
 
453 aa  217  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  30.89 
 
 
566 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  27.88 
 
 
564 aa  107  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  25.09 
 
 
567 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  23.83 
 
 
580 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  25.45 
 
 
572 aa  87.4  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  64.71 
 
 
78 aa  82  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  27.27 
 
 
565 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  25 
 
 
527 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  23.49 
 
 
578 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  24.74 
 
 
564 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  57.14 
 
 
115 aa  63.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  22.4 
 
 
572 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  58.33 
 
 
48 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2723  hypothetical protein  40.66 
 
 
158 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000012613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  27.03 
 
 
158 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>