57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2334 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  74.62 
 
 		 525 aa  783    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  70.24 
 
 		 527 aa  737    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  86.15 
 
 		 531 aa  920    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1064    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  79.54 
 
 		 521 aa  840    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  67.55 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  48.05 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  47.54 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  47.25 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  46.67 
 
 		 511 aa  487  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  46.05 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  46.21 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  45.72 
 
 		 508 aa  475  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  48.06 
 
 		 517 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  48.25 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  47.12 
 
 		 517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  45.54 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  44.47 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  45.17 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  46.81 
 
 		 569 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  44.64 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  47.57 
 
 		 515 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  46.55 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  44.75 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  47.3 
 
 		 519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  47 
 
 		 516 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  47.39 
 
 		 522 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  45.92 
 
 		 521 aa  448  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  44.27 
 
 		 505 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  43.68 
 
 		 520 aa  448  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  44.25 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  43.86 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  47.09 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  46.15 
 
 		 519 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  43.55 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  42.5 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  36.43 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  39.42 
 
 		 510 aa  343  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  35.98 
 
 		 517 aa  342  8e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  35.1 
 
 		 516 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  35.05 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  35.38 
 
 		 539 aa  321  3e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  34.71 
 
 		 536 aa  306  7e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  66.42 
 
 		 158 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  28.01 
 
 		 567 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  24.6 
 
 		 580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  25.92 
 
 		 572 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  22.24 
 
 		 564 aa  95.9  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  27.83 
 
 		 527 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  24.84 
 
 		 566 aa  88.6  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  55.13 
 
 		 78 aa  88.2  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  28.95 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  27.56 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  26.75 
 
 		 564 aa  76.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  26.99 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  65.96 
 
 		 115 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  53.19 
 
 		 48 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>