58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1564 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  100 
 
 
505 aa  1029    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  83.56 
 
 
569 aa  863    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  80.99 
 
 
505 aa  845    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  75.45 
 
 
505 aa  798    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  78.42 
 
 
505 aa  826    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  77.62 
 
 
505 aa  816    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  76.63 
 
 
505 aa  802    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  76.44 
 
 
505 aa  806    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  80 
 
 
505 aa  843    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  79.8 
 
 
505 aa  840    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  59.88 
 
 
520 aa  626  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  47.98 
 
 
522 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  45.7 
 
 
519 aa  482  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  45.54 
 
 
523 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  46.5 
 
 
525 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  47.3 
 
 
515 aa  455  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  47.17 
 
 
509 aa  456  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  44.79 
 
 
531 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  47.17 
 
 
511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  47.29 
 
 
507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  46.5 
 
 
514 aa  442  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  45.61 
 
 
521 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  46.81 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  45.24 
 
 
521 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  44.49 
 
 
527 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  45.91 
 
 
515 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  44.94 
 
 
515 aa  434  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  43.75 
 
 
516 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  45.01 
 
 
517 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  45.16 
 
 
519 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  43.82 
 
 
521 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  44.38 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  43.86 
 
 
517 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  42.5 
 
 
522 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  41.44 
 
 
516 aa  398  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  41.73 
 
 
514 aa  359  6e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  41.3 
 
 
517 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  39.04 
 
 
514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  47.43 
 
 
453 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  39.47 
 
 
516 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  36.85 
 
 
510 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  37.48 
 
 
539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  37.29 
 
 
536 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  26.35 
 
 
564 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  24.7 
 
 
567 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  44.96 
 
 
158 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  27.81 
 
 
572 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  24.82 
 
 
580 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  59.74 
 
 
78 aa  97.4  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  24.49 
 
 
564 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  28.53 
 
 
566 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  26.32 
 
 
565 aa  83.6  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  21.52 
 
 
527 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  25.97 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  52.94 
 
 
115 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  26.71 
 
 
572 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  52.94 
 
 
48 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2723  hypothetical protein  36.51 
 
 
158 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000012613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>