58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1241 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  80.61 
 
 
522 aa  888    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1071    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  64.22 
 
 
520 aa  695    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  47.42 
 
 
569 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  47.59 
 
 
505 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  47.04 
 
 
505 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  46.24 
 
 
505 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  47.04 
 
 
505 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  47.23 
 
 
505 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  45.7 
 
 
505 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  46.08 
 
 
505 aa  479  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  45.89 
 
 
505 aa  481  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  45.28 
 
 
505 aa  475  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  46.63 
 
 
515 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  47.8 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  46.45 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  46.64 
 
 
509 aa  463  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  44.34 
 
 
531 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  45.54 
 
 
508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  45.86 
 
 
511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  43.55 
 
 
523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  43.6 
 
 
525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  45.16 
 
 
521 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  42.77 
 
 
527 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  44.38 
 
 
517 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  42.77 
 
 
517 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  42.29 
 
 
521 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  43.6 
 
 
515 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  42.88 
 
 
519 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  42.29 
 
 
519 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  40.66 
 
 
516 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  41.17 
 
 
515 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  38.91 
 
 
522 aa  391  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  40.23 
 
 
516 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  40.31 
 
 
521 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  38.07 
 
 
510 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  43.28 
 
 
453 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  37.66 
 
 
536 aa  319  7e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  35.31 
 
 
514 aa  316  7e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  34.48 
 
 
516 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  35.1 
 
 
514 aa  296  5e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  34.48 
 
 
517 aa  294  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  34.39 
 
 
539 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  25.22 
 
 
580 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  27.98 
 
 
572 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  25.69 
 
 
564 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  24.47 
 
 
566 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  23.82 
 
 
567 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  61.04 
 
 
78 aa  95.9  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  34.31 
 
 
158 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  24.48 
 
 
564 aa  90.1  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  26.95 
 
 
578 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  23.89 
 
 
527 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  25.57 
 
 
572 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  38.36 
 
 
115 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  58.33 
 
 
48 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2723  hypothetical protein  40.74 
 
 
158 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000012613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>