58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0535 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  79.8 
 
 
505 aa  840    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1017    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  80.99 
 
 
505 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  84.16 
 
 
505 aa  867    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  82.97 
 
 
505 aa  851    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  84.36 
 
 
505 aa  873    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  63.58 
 
 
520 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  85.35 
 
 
505 aa  891    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  83.17 
 
 
505 aa  865    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  85.74 
 
 
505 aa  882    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  78.42 
 
 
569 aa  818    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  47.41 
 
 
522 aa  491  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  47.23 
 
 
519 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  48.73 
 
 
509 aa  461  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  47.49 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  49.13 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  44.75 
 
 
523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  48.74 
 
 
507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  48.94 
 
 
508 aa  451  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  48.73 
 
 
511 aa  450  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  43.6 
 
 
531 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  44.34 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  45.47 
 
 
519 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  43.33 
 
 
527 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  45.14 
 
 
521 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  45.03 
 
 
517 aa  428  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  44.05 
 
 
521 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  45.45 
 
 
515 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  44.66 
 
 
515 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  44.49 
 
 
521 aa  420  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  44.83 
 
 
516 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  44.94 
 
 
517 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  44.21 
 
 
519 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  42.83 
 
 
522 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  43.33 
 
 
516 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  41.15 
 
 
514 aa  350  3e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  40.54 
 
 
517 aa  342  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  39.23 
 
 
514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  39.85 
 
 
516 aa  335  9e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  44.29 
 
 
453 aa  312  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  37.48 
 
 
539 aa  302  9e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  36.49 
 
 
510 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  37.55 
 
 
536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  26.92 
 
 
564 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  24.77 
 
 
567 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  28.29 
 
 
572 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  26.38 
 
 
564 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  25.25 
 
 
580 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  28.32 
 
 
566 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  61.04 
 
 
78 aa  97.1  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  41.18 
 
 
158 aa  97.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  27.05 
 
 
565 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  22.68 
 
 
527 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  29.17 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  27.56 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  52.94 
 
 
115 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2723  hypothetical protein  36.49 
 
 
158 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000012613  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  52.08 
 
 
48 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>