58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1046 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  63.58 
 
 
505 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  65.7 
 
 
522 aa  709    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  61.85 
 
 
505 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  63.65 
 
 
505 aa  660    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  62.04 
 
 
505 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1058    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  64.16 
 
 
505 aa  666    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  64.22 
 
 
519 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  61.46 
 
 
505 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  62.12 
 
 
505 aa  633  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  59.88 
 
 
505 aa  626  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  59.92 
 
 
505 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  59.19 
 
 
569 aa  621  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  47.68 
 
 
509 aa  455  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  47.6 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  47.69 
 
 
508 aa  451  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  43.68 
 
 
523 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  47.5 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  46.3 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  47.68 
 
 
511 aa  442  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  42.94 
 
 
531 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  42.61 
 
 
525 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  41.6 
 
 
527 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  43.33 
 
 
519 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  43.74 
 
 
517 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  43.19 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  43.68 
 
 
517 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  42.77 
 
 
516 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  41.87 
 
 
515 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  41.73 
 
 
521 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  42.53 
 
 
515 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  40.61 
 
 
521 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  40.55 
 
 
522 aa  388  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  41.78 
 
 
519 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  41.09 
 
 
516 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  44.17 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  38.39 
 
 
514 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  37.02 
 
 
510 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  36.19 
 
 
514 aa  300  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  36.19 
 
 
539 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  36.76 
 
 
517 aa  295  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  36.62 
 
 
516 aa  292  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  36.11 
 
 
536 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  26.93 
 
 
580 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  25.86 
 
 
567 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  27.13 
 
 
572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  28.09 
 
 
564 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  61.54 
 
 
78 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  28.08 
 
 
566 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  27.73 
 
 
564 aa  97.4  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  34.51 
 
 
158 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  28.81 
 
 
565 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  22.72 
 
 
527 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  28.01 
 
 
578 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  25.72 
 
 
572 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  46.67 
 
 
115 aa  57  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2723  hypothetical protein  42.59 
 
 
158 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000012613  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  50 
 
 
48 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>