56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2335 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  68.73 
 
 		 525 aa  716    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  86.15 
 
 		 523 aa  920    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1081    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  69.92 
 
 		 527 aa  748    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  77.93 
 
 		 521 aa  820    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  67.28 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  47.89 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  46.9 
 
 		 514 aa  500  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  47 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  44.47 
 
 		 511 aa  475  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  47.89 
 
 		 517 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  47.6 
 
 		 517 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  47 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  45.4 
 
 		 507 aa  466  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  45.09 
 
 		 522 aa  463  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  44.1 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  44.47 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  44.79 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  45.95 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  43.46 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  42.36 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  43.6 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  45.33 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  44.34 
 
 		 519 aa  443  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  45.61 
 
 		 519 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  46.17 
 
 		 519 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  46.35 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  42.94 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  45.04 
 
 		 521 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  43.11 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  43.13 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  42.91 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  44.51 
 
 		 569 aa  438  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  45.17 
 
 		 521 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  45.38 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  42.72 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  39 
 
 		 510 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  34.28 
 
 		 514 aa  333  6e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  35.66 
 
 		 514 aa  330  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  35.22 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  32.83 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  35.74 
 
 		 539 aa  320  5e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  35.4 
 
 		 536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  67.39 
 
 		 158 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  27.21 
 
 		 567 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  25 
 
 		 580 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  24.31 
 
 		 572 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  22.2 
 
 		 564 aa  86.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  27.41 
 
 		 527 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  53.25 
 
 		 78 aa  82.4  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  24.51 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  26.58 
 
 		 578 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  26.73 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  26.8 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  25.87 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  60.87 
 
 		 115 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>