58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1025 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  77.62 
 
 
505 aa  816    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  84.36 
 
 
505 aa  873    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  83.37 
 
 
505 aa  875    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  85.15 
 
 
505 aa  880    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  80.59 
 
 
505 aa  838    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1019    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  62.04 
 
 
520 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  82.38 
 
 
505 aa  862    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  83.17 
 
 
505 aa  864    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  86.34 
 
 
505 aa  897    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  79.01 
 
 
569 aa  828    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  48.18 
 
 
522 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  47.59 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  48.73 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  46.89 
 
 
515 aa  455  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  48.25 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  48.93 
 
 
511 aa  449  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  44.27 
 
 
523 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  47.95 
 
 
507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  48.05 
 
 
508 aa  444  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  46.02 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  43.13 
 
 
531 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  45.14 
 
 
517 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  44.57 
 
 
521 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  45.12 
 
 
521 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  45.63 
 
 
515 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  44.53 
 
 
517 aa  425  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  43.16 
 
 
525 aa  428  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  45.4 
 
 
516 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  43.88 
 
 
515 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  44.08 
 
 
521 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  42.36 
 
 
527 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  44.59 
 
 
519 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  42.97 
 
 
522 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  42.11 
 
 
516 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  40.58 
 
 
514 aa  353  5e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  38.7 
 
 
514 aa  334  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  39.39 
 
 
517 aa  334  3e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  39.28 
 
 
516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  45.82 
 
 
453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  35.28 
 
 
510 aa  297  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  37.2 
 
 
539 aa  289  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  35.85 
 
 
536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  24.4 
 
 
567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  23.94 
 
 
572 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  26.26 
 
 
564 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  25.31 
 
 
564 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  24.69 
 
 
580 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  29.43 
 
 
566 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  61.04 
 
 
78 aa  96.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  39.71 
 
 
158 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  23.75 
 
 
527 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  28.21 
 
 
578 aa  73.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  27.18 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  52.94 
 
 
115 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2723  hypothetical protein  37.84 
 
 
158 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000012613  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  54.17 
 
 
48 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>