More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0055 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0055  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
698 aa  1407    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0277  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.01 
 
 
696 aa  559  1e-158  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.75 
 
 
692 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.17 
 
 
695 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.13 
 
 
676 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.37 
 
 
686 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.21 
 
 
682 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.58 
 
 
690 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.16 
 
 
694 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.07 
 
 
708 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.54 
 
 
695 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.3 
 
 
692 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.01 
 
 
692 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.54 
 
 
703 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.21 
 
 
686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.94 
 
 
688 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.15 
 
 
674 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.38 
 
 
679 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.59 
 
 
695 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.45 
 
 
703 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.09 
 
 
696 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.03 
 
 
703 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.02 
 
 
693 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.03 
 
 
680 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.39 
 
 
694 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.32 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.06 
 
 
697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.9 
 
 
696 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.98 
 
 
689 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.12 
 
 
673 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.74 
 
 
694 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.29 
 
 
699 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0182  type III secretion FHIPEP protein  42.77 
 
 
706 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00304164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.59 
 
 
688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.53 
 
 
681 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.69 
 
 
678 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.42 
 
 
700 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.29 
 
 
690 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.27 
 
 
700 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.16 
 
 
678 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.69 
 
 
678 aa  435  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.72 
 
 
695 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1638  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.89 
 
 
692 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.885636  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.55 
 
 
693 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.12 
 
 
695 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.43 
 
 
706 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.01 
 
 
699 aa  429  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.16 
 
 
692 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.18 
 
 
700 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.39 
 
 
692 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.07 
 
 
711 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.31 
 
 
697 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  37 
 
 
708 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.09 
 
 
697 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.93 
 
 
677 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.08 
 
 
717 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.61 
 
 
699 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 
700 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.95 
 
 
700 aa  422  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.74 
 
 
698 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  38.02 
 
 
694 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.02 
 
 
699 aa  418  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.12 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.26 
 
 
696 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.67 
 
 
702 aa  419  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2262  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.89 
 
 
695 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.73 
 
 
700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.4 
 
 
700 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.79 
 
 
698 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.6 
 
 
700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.62 
 
 
699 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.39 
 
 
693 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.24 
 
 
702 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.52 
 
 
694 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.6 
 
 
700 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.91 
 
 
699 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.91 
 
 
699 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.44 
 
 
694 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.26 
 
 
687 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.77 
 
 
699 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.44 
 
 
694 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.5 
 
 
680 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2029  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.02 
 
 
684 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.76 
 
 
692 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.97 
 
 
699 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.87 
 
 
693 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.21 
 
 
687 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.43 
 
 
680 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.6 
 
 
700 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.6 
 
 
700 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.07 
 
 
710 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.6 
 
 
700 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.47 
 
 
699 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>